Situata all'incrocio di via San Marco con via Sławkowska. La chiesa fu fondata nel 1263 dal principe Boleslao il Timido per i frati dell'ordine di Sant'Agostino, arrivati da Praga. Verso la fine del XIII secolo fu costruito il presbiterio in muratura chiuso con la parete diritta. Nel corso del XV secolo fu edificata l'ossatura a tre navate della stessa altezza.

All'inizio del XIX secolo il governo austriaco subentrò nel possesso del monastero e della chiesa. Negli anni Trenta del XX secolo una parte del monastero fu distrutta e poi ristrutturata ed adibita a negozi in via Sławkowska.

Sulla parete esteriore del presbiterio si trova la copia di Golgota del 1500: la croce gotica con Christo e le statue di Vergine Maria Addolorata e di San Giovanni Evangelista. Secondo la tradizione, la scultura parlò a beato Michał Giedroyc, che è sepolto accanto all'altare maggiore. Nella chiesa si trova la sua tomba (del XVII secolo) e cosiddetto Giedroycianum - il santuario in cui vengono raccolti i ricordi del frate. La bella scultura del San Michele Arcangelo fu eseguita da un artista del circolo di celebre scultore Baltazar Fontana.

Nella chiesa c'è anche la Cappella di Vergine Maria di Częstochowa, in cui si trova il quadro meraviglioso della Madonna.